近日,一项刊文在国际杂志Nature Biotechnology上并作“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的调查结果里,来自欧洲各国分子遗传学研究工作小分组等机构的科学家们通过研究工作将有本机小肠动物细胞分组里所有已知的菌株遗传物质汇编如此一来了一个大型的第一版,从而就能帮助研究工作医务人员险恶即使菌株遗传物质和蛋白之间的关联,以及其对有本机健康的冲击。
菌株遍布新陈代谢道核心份,其尽可能产生蛋白质来冲击本机新陈代谢、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于新陈代谢道动物细胞分组如此一来员的数量要比新陈代谢道细胞还要多,之部份菌株、真菌和其它动物细胞;为了阐释菌株在有本机遗传学里所角色的关键剧里,科学家们通常会在研究工作小分组里转化并对其养如此一来,随后在对菌株展开DNA测序,然而现阶段很多菌株还无法在研究工作小分组的环境污染里被养如此一来繁殖。
为了获这些菌株的具体信息,研究工作医务人员采取了另部份一种统计分析方法,他们从环境污染里(比如小肠)利用实体抽取,随后在对整个抽取里的DNA展开测序,然后利用计算机统计分析方法对来自实体抽取里的数千种生境的个体遗传物质展开重建,这种统计分析方法被称之为宇遗传物质学高效率,该高效率能作为一种替代统计分析方法对单个生境的DNA展开转化和测序。
险恶研究工作Rob Finn表示,当年之部份我们在内的三个法理团队重建了如此一来千上万个小肠动物细胞分组遗传物质,而最小的难题就是这些团队所想得到的结果是否不具备相比较,以及是否能将这些结果汇编如此一来为一个非常全盘的目录。现阶段研究工作医务人员已经从有本机小肠里多达4600种菌株群落里汇编了20万个遗传物质和1.7亿个蛋白质序列,这种新型的第一版(标准化的有本机新陈代谢系统遗传物质集合和标准化的新陈代谢系统蛋白质第一版)揭示了本机小肠的巨大多样性,并为全面性展开小肠动物细胞分组研究工作铺平了干道。
险恶研究工作插图借助于的这个巨大的第一版是动物细胞分组研究工作的一个里程碑,今后或将能为科学家们提供非常宝贵的资源来研究工作有本机小肠生态系统里每一种菌株所角色的关键剧里。这项研究工作表明,多达70%被检测到的菌株从而在研究工作小分组里被如此一来功养如此一来过,而其在母体的活性几乎未知,而这类菌株里最小的群体就是Comantemales;险恶研究工作表示,看到Comantemales如此普遍真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对小肠里的菌株相符合,我期望这个第一版能帮助生物信息学家和分子遗传学家在今后几年弥补这一专业知识值得注意。
该第一版/第一版利用的所有抽取都能在在线资源Mgnify里获,其能帮助科学家们统计分析动物细胞的遗传物质抽取并且与当前的第一版展开对比;随着世界各地研究工作团队不断披露新的第一版,该第一版就会扩大到之部份其它本机口腔的动物细胞分组,比如皮肤或口腔核心等口腔。最后险恶研究工作表示,这一第一版的汇编今后或为微遗传学家和临床实验工作医务人员提供非常丰富的资源,然而研究工作医务人员就会在南美洲、亚太地区和非洲等代表性太少的北部找到不够多新的菌株生境,现阶段研究工作医务人员并不吻合不同人群里菌株多样性的差异和变化情况。
原始借助于处:
Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.
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