Cell Res:北京基因组所合作了解到 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

2022-01-31 03:39:03 来源:
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R-loop 是一种由 RNA:DNA 杂合末端和遗传物质 DNA 组成的特殊蛋白质结构上,在脱氧核糖蛋白质和原核生物生物的遗传里面产自国际上且普遍存在。R-loop 在很多这两项的生物学全过程里面展现重要特性,包括染色质;也、核苷酸依赖性、DNA 损伤修复以及遗传平稳性等,但其如何被精确依赖性的机制尚不确切。m6A ;也作为信使 RNA 上丰度最高的;也并不一定,国际上参与灵长类动物的胚胎、免疫、肿瘤细胞更新、脂肪展现展现作用、以及分解成和移往等生命全过程。然而,目前尚不确切 m6A 确实能作为 R -loop 里面 RNA 成份的本源特征来依赖性 R -loop 素质,进而展现各种生物学特性。清华大学北京遗传研究课题所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前和文小组合作伙伴研究课题,发掘出 m6A 能平稳 R-loop 的过渡到,进而依赖性遗传核苷酸的有效重启。这一全面性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞研究课题》(Cell Research)杂志。研究课题小组首先通过黄褐色分子杂交和免疫荧光新技术,发掘出敲低 m6A 的大基移往酶 METTL3 非同着降低 R -loop 素质,且该依赖性展现作用意味着 METTL3 的大基移往酶活性。随后,小组成员运用高效气相组分联合质谱新技术,发掘出比起于染色体相结合的 RNA(caRNA),R-loop 的 RNA 成份有更加非金属的 m6A ;也。促使运用基于遗传物质 DNA 建库的 DNA:RNA 杂合末端免疫共沉淀高通量测序新技术(ssDRIP-seq),发掘出缩水的 R -loop 主要非金属在核苷酸重启区域,R-loop 变化程度与 m6A 的距离和;也素质相关。为了冒险 m6A 对 R -loop 依赖性的生物学特性,研究课题小组绘出了 RNA 聚合酶核苷酸亚基的图像图集,并在 MYC、ACTIN 遗传上展开多种核苷酸活性测定,发掘出 m6A 推动 R -loop 过渡到是核苷酸重启期中的这两项步骤,可以避免 RNA 聚合酶的核苷酸通读。仍要,小组成员相结合了针对核苷酸通读的报告遗传系统,通过 m6A ;也亚基的突变促使证实 m6A 对于 R -loop 过渡到及核苷酸重启的这两项展现作用。该研究课题发掘出了 m6A 的大基化;也的共核苷酸依赖性特性,阐明了 RNA 的大基化;也对染色质结构上的直接影响,以及 R-loop 结构上里面的 RNA 成份被;也后对其自身稳态的依赖性机制,说明了了 m6A 通过平稳 R-loop 而推动核苷酸正常重启的现象,为促使研究课题 m6A 与 R-loop 的依赖性机制和附加生物学特性透过了分析方法上的新技术和分析方法支撑。该研究课题得到了里面国科学院策略性作准备生物科技专项、国家自然科学以及国家重点开发计划等基金资助。原始出处:Xin Yang, Qian-Lan Liu, Wei Xu, et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).
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